Správny substrát je dôležitou súčasťou chovu leguána. Musí zohľadňovať druh, vek zvieraťa, vlhkosť v teráriu aj spôsob kŕmenia. Nevhodný substrát môže zhoršiť hygienu, podporiť rast plesní alebo zvýšiť riziko zdravotných problémov pri jeho požití. Aký substrát je